A Diretoria da AMUPE é composta pelos Prefeitos dos Municípios associados, eleitos por voto.
A diretoria eleita em 15 de abril de 2009, para um mandato de dois anos, tem a seguinte composição:

Diretoria Executiva                                  

Presidente: Antonio João Dourado - Lajedo    
Vice-Presidente: Jandelson Gouveia da Silva - Escada        
1º Secretário: Geovani de Oliveira Melo Filho - Itaquitinga        
2º Secretário: Leandro Rodrigues Duarte – Santa M. Boa Vista     
1º Tesoureiro: Jadiel Cordeiro Braga – São Caetano            
2º Tesoureiro: José Cavalcanti Alves Júnior – ArcoVerde          

Conselho Fiscal

Titulares 1. Lourival Antônio Simões Neto - Petrolândia                                      
               2.Genivaldo Menezes Delgado – Águas Belas                                
               3. Gerôncio Antônio Figueiredo Silva - Trindade                           

Suplentes1. Rogério Araújo Leão – São José do Belmonte                                    
               2. Luiz Wilson Ulisses Sampaio - Araripina                                    
               3. Severino Alexandre Sobrinho - Araçoiaba                          

Conselho Deliberativo

1ª Região     
                Titular: Gesimário Pessoa Baracho - Igarassú           
                Suplente: Rubens Catunda da Silva Filho - Itamaracá              

2ª Região     
                Titular: Azoka José Maciel Gouveia - Aliança 
                Suplente: Cláudio Estácio Honório da Costa – Chã de Alegria      

3ª Região     
               Titular: Antônio Figueiroa de Siqueira – Santa Cruz do Capibaribe         
               Suplente: Luiz Antônio de Araújo - Salgadinho          

4ª Região     
              Titular: Diogo Alexandre Gomes Neto – Chã Grande           
              Suplente: Reginaldo Machado Dias - Quipapá   

5ª Região     
              Titular: César Augusto de Freitas - Sanharó   
              Suplente: José Sávio Omena - Altinho     

6ª Região
             Titular: Nivaldo Lúcio de Oliveira Júnior - Correntes      
             Suplente: Pedro Antônio Vilela Barbosa – São João           

7ª Região     
             Titular: Adelmo Alves de Moura - Itapetim       
             Suplente: Carlos Evandro Pereira de Menezes – Serra Talhada        

8ª Região
            Titular: Marcones Liborio de Sá - Salgueiro         
            Suplente: Bartolomeu Tiburtino de Carvalho Barros – Mirandiba    

9ª Região     
              Titular: Romero Magalhães Lêdo - Itacuruba  
              Suplente: Rosana de Moura Maniçoba Novaes Ferraz - Floresta